Logiciels pour la Chimie

Visualisation de molécules

Rasmol (logiciel utilisant le format .pdb)
http://www.umass.edu/microbio/rasmol
http://en.wikipedia.org/wiki/Rasmol

http://jmol.sourceforge.net
http://pymol.sourceforge.net
voir aussi RASTop, Chime, Protein Explorer, MOLusc basé sur le format .pdb

ChemSketch http://www.acdlabs.com
ChemDraw Chem3D http://scistore.cambridgesoft.com
ISISDraw http://www.mdli.com

Quelques banques de molécules

http://www.faidherbe.org/site/cours/dupuis/banque.htm (illustration de la méthode VSEPR)
http://www.faidherbe.org/site/cours/dupuis/diaster.htm (isomérie Z/E)
http://cmm.info.nih.gov/modeling/pdb_at_a_glance.html
http://molbio.info.nih.gov/cgi-bin/pdb
http://www.ac-nancy-metz.fr/enseign/physique/CHIM/rasmol/molecules.zip
http://www.inrp.fr/Acces/Biogeo/model3d/rasmol.htm
http://www.bernstein-plus-sons.com/software/rasmol/
http://librairiedemolecules.education.fr/
ftp://ftp.ac-grenoble.fr/ge/chemistry/molecules.tgz
http://www.rcsb.org/pdb

Description du format .pdb (à éditer dans un éditeur de texte comme Notepad sous Windows ou Emacs sous Linux ou Aquamacs sur Mac)

http://alpha2.bmc.uu.se/~kenth/bioinfo/pdb/pdbexpl.html
http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank
http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_Data_Bank_%28file_format%29
http://www.rcsb.org/pdb/file_formats/pdb/pdbguide2.2/guide2.2_frame.html
http://www.umass.edu/microbio/rasmol/pdb.htm

http://stein.bioch.dundee.ac.uk/~charlie/software/pdb-mode/pdb-mode.html (un mode pdb pour Emacs)

Autres formats de description de molécules : .bio .pdb .xyz

http://pyquante.sourceforge.net
http://www.umass.edu/microbio/rasmol/index2.htm
http://www.chemicalgraphics.com/PovChem
http://bkchem.zirael.org/index.html

http://www.knowitall.com/academic/ KnowItAll (ChemWindows pour dessiner des molécules en 2D, SymApps pour calculer les angles et obtenir une vue en 3D)

Quelques exemples personnels

Données thermodynamiques/chimiques

http://webbook.nist.gov
http://www.metallurgy.nist.gov/phase/solder/solder.html (diagrammes de phase de systèmes binaires et ternaires calculés)
http://kinetics.nist.gov/index.php (cinétique)
http://srdata.nist.gov/solubility (solubilité)
http://daecr1.harvard.edu/pdf/evans_pka_table.pdf (ionisation)
http://wulfenite.fandm.edu/Data%20/Data.html
http://www.epa.gov/chemfact
http://www.iupac-kinetic.ch.cam.ac.uk/publications.html
http://jpldataeval.jpl.nasa.gov

Oxydo réduction

http://perso.wanadoo.fr/serge.ballery/mole/oxydoreduction/gamma.swf

Réactions acido-basique

http://www.linux-france.org/prj/xem/index.html
http://jeanmarie.biansan.free.fr/dozzzaqueux.html
http://sciences-physiques.ac-dijon.fr/documents/Java/pages/dosage.htm
http://www.discip.ac-caen.fr/phch/lycee/terminale/dosage/dosage.htm

voir aussi :

Chimie
TICE

www.celles.net

LogicielsPourLaChimie

Logiciels pour la Chimie

Visualisation de molécules

Oxydo réduction

Réactions acido-basique